商务公寓和写字楼都是商业用房，但存在以下区别：

使用方式：商务公寓可以商住两用，既可以用来办公，也可以用来居住，而写字楼只能用于商业办公。

配套设施：商务公寓中主要是满足人们日常生活的需求，其中包括卧室、起居室、客厅、浴室、厕所、厨房等等，在公寓的周围会有各种生活用品的售卖。一般的小型写字楼由于主要用于办公，所以一般只有水电和厕所。

软件服务：商务公寓属于精装修交房标准，拎包即可入住，配套设施完善，在管理上主要由物业管理，维护公寓水、电、卫生和设施安全就可以了。写字楼的服务一方面体现在高效的物业管理上，另一方面体现在对入住企业的专业化商务服务上。

建筑文化：商务公寓一般没有什么建筑文化上的需要，而写字楼则与之相反。